首先，耳機要防止受到大的振動，定製耳機的動鐵單元都是固定在腔體內部的，不過並不是十分的結實，所以要避免碰撞、跌落或者是撞擊，不然都會造成定製耳機動鐵單元的以為或者是脫落，輕則定製耳機會偏音，重則無法正常工作，所以定製耳機一般都會附送金屬便攜盒和硬殼便攜包，定製耳機的保護非常重要。

定製耳機不僅要注意防振，平時使用中也要注意防潮，一旦有水分進入耳機要及時的進行乾燥，還要注意耳垢和耳油進入耳機的內部，進入會導致耳機單元的損壞。然後就是噴嘴的清潔，定製耳機是屬於入耳式耳塞的一種，所以它的調音也與定製耳塞如出一轍，定製耳機的音色取向在很大的程度上是取決於噴嘴導管的狀態，如果耳垢清理的不夠及時，很有可能堵塞定製耳機的噴嘴，再加上沒有濾網的定製耳機那麼就很有可能造成定製耳機的損壞。