西芹爛心也是一種生理病害。開始是心葉的葉脈間變成褐色，以後因為周圍細胞死亡而變成黑褐色，所以又稱黑心病。主要發生在11-12片真葉長出以後，收穫前1個月以內。

發生爛心的主要原因是缺鈣。在酸性土壤上容易發生缺鈣。或者土壤中並不缺鈣，但是某些原因影響了鈣的吸收，植株同樣表現出缺鈣症狀。一般在高溫、乾旱、施肥過多的條件下發生。棚溫過高、水分嚴重不足時，阻礙鈣的吸收，也常發生爛心。土壤中氮、鉀、鎂過多，由於拮抗作用也會影響對鈣的吸收，即使吸收以後，也不能很好地運轉，心葉部分照樣腐爛。土壤鹽類濃度過高時，會影響鈣的吸收，因此，肥料1次施用量不可過多。

缺硼也可發生爛心。缺棚的原因是土壤中有效硼含量偏低或由於拮抗作用而使植株不能正常吸收硼素。土壤ph值在7。1-8。1的範圍內，硼的有效性降低，易發生缺硼症狀。輕質土壤的有效硼含量常少於黏質土壤，輕質土壤發生缺硼的機率也較多。

有機質含量過低的土壤，有效硼含量較少，也易發生缺硼。高溫、乾旱使土壤中硼的有效性降低，容易發生缺硼。土壤中氨態氮和鉀素過多時，西芹吸硼困難。土壤中鈣含量過多或不足時，影響西芹對硼素的吸收。

缺鈣與缺硼造成爛心的症狀足不同的。缺鈣時生長點萎縮死亡，幼葉早期死亡常伴隨嫩葉邊緣焦灼病，小葉尖端葉緣扭曲。缺硼時沿著幼葉邊緣向內逐漸褐變，最後心葉壞死。常伴隨心葉葉柄內側變成褐色井龜裂，外葉的葉柄老朽開裂導致“莖折”。

防止西芹爛心，應根據症狀查清原因，採取相應的措施。缺鈣時葉面噴灑0。5%的氯化鈣或硝酸鈣2-3次。缺硼時葉面噴灑0。2%-0。3%的硼砂或硼酸加0。3%的生石灰2～3次。同時，應注意調節棚室溫溼度、追肥配比和土壤水分。要特別注意防止早害和溼害的發生。