公元231年，諸葛亮興師北伐，負責後方糧草的正是李嚴。而就在諸葛亮在前方與魏軍交戰之時，卻得知後方糧草沒有跟上，所謂三軍未動，糧草先行，一旦糧草沒跟上，等待他們的就是滅頂之災，於是諸葛亮被迫退兵，此次北伐宣告失敗。

建安十八年，劉備按照諸葛亮的《隆中對》圖謀西川，劉瑣、冷苞、張任、鄧賢帶著劉璋的囑託在涪陵防範。久疏戰陣的劉璋軍自然不是劉備的對手，三下五除二涪陵失守了，當失利的訊息傳回成都可嚇壞了劉璋。環顧一下朝堂上的大臣，只有李嚴還能獨當一面。本以為勝券在握的劉璋，因所託非人而失去了根據地。緣於李嚴打開了綿竹的大門，讓劉備進入成都沒費一兵一卒！

公元230年，曹真上書魏明帝討伐蜀漢，魏明帝批准，並下令司馬懿配合曹真。曹魏軍隊分為三路。曹魏大司馬曹真從斜谷道攻入蜀漢，而鎮守襄陽的大將軍司馬懿從漢水坐船由西城攻入，司馬懿和曹真在漢中匯合，而其他各個將領，一部分安排從子午道攻入蜀漢，而另一部分從武都郡攻入蜀漢。在曹魏大軍來襲之時，諸葛亮下令讓李嚴帥兵兩萬人前來增援漢中，李嚴這個時候卻派人和諸葛亮說曹魏的司馬懿等人都開府了。這裡解釋一下，開府就是建立府署並自選僚屬之意，漢朝本來只有三公可以開府，漢末才發生變化。

諸葛亮回朝後，拿出李嚴的親筆書信，撤軍原委真相大白。兩人對質的結果是，李嚴詞窮，叩首認罪。諸葛亮也終於忍無可忍，再讓他這樣在朝中搬弄是非，顛倒黑白，自己也沒法安心在外帶兵北伐，因此就決定罷黜李嚴。諸葛亮罷黜李嚴不是因為個人恩怨，打擊報復李嚴，而是聯合朝中各方勢力，大小二十多名官員，聯名上書罷免他的，同為託孤大臣，葛亮一心為公，執法必嚴，且公平公正，李嚴卻處處掣肘，不予配合，謀權謀私，這完全違背了劉備託孤的初衷，同僚們也是看在眼裡，記在心間，所以李嚴被廢完全是咎由自取。