洪武十三年（1380），胡惟庸一案爆發，此案牽連甚廣，並且連續追查數年，最後被殺者超過一萬人，但有一人，與胡惟庸聯絡密切，卻並未受到牽連，此人正是李善長。李善長的弟弟李存義，是胡惟庸的兒女親家，而且後來李善長也的確默許了胡惟庸的所作所為，朱元璋這樣多疑之人，為何沒有對李善長動手呢？
胡惟庸一案爆發之後，朝中大多數官員均被斬首，但此案卻並沒有以胡惟庸的死告終，這個案件一直在繼續追查，目的就是為了將胡惟庸的同夥全都剿滅。這段時間，無論是朝廷之上，還是民間，每個人都人心惶惶，因為隨時可能因為一個人的供詞，再次引起一場屠殺。
這個案件持續數年，卻一直沒有正式結束，朱元璋在等什麼呢？沒錯，他等的就是李善長的人頭！
李善長作為明初第一大功臣，在朝中的地位和影響力都是不容小覷的，這也是朱元璋留他性命的原因之一。胡惟庸一案爆發，李善長雖然沒有被問罪，但是他們一家卻被放逐到崇明島。李善長是個明白人，他知道自己活不了多久了，因為朱元璋是一個“要麼不做，要麼做絕”的人，李善長又有什麼資本，能夠成為朱元璋的例外呢？朱元璋等待的，不過是個機會罷了。
洪武二十二年，李善長在家修房子，他想起了老朋友湯和，於是向湯和借了三百士兵來幫他修房子。湯和很爽快地答應了，但是等李善長帶走這三百士兵後，湯和立即將此事彙報給了朱元璋，朱元璋等待的機會，來了，但朱元璋並沒有立即動手。
不久之後，李善長的親信丁斌犯法被判流放，李善長跑到朱元璋面前求情，結果後來丁斌雖然沒有被流放，卻也沒有從大牢裡出來，朱元璋將丁斌囚禁在大牢之中，日夜拷打。不久之後，丁斌向朱元璋供認了李存義和胡惟庸謀反的細節，朱元璋大怒，立即抓來李存義問罪。嚴刑拷打之下，李存義又交代了自己勸說李善長的全過程，李善長那句“汝等自為之”成了他的催命符。
這個時候，李善長的家丁見他即將倒臺，為了撇清關係，李善長的家奴以受害者的身份向朱元璋控訴李善長的罪行，家奴們說自己長期以來一直受到李善長的欺壓，而且李善長曾積極參與胡惟庸謀反一案，還將時間地點說得非常詳細。不僅如此，御史大臣們也紛紛上書彈劾李善長，就連欽天監的官員都暗示朱元璋“當移大臣”。
就這樣，李善長及其三族，全被送上了刑場。
如果仔細分析的話，其實會發現李善長謀反的動機並不明確。李善長的兒子娶了公主，他不僅是朱元璋的親家，還是明朝第一重臣，手握兩張嗎，免死鐵券，殊榮至此，他的確沒有謀反的理由。只不過他的確曾被李存義說服，雖未言明，卻也算是默許了他們的所作所為，朱元璋震怒，也的確情有可原。
李善長死後，胡惟庸一案終於了結。
