之前的飛船與空間站核心艙的對接都是一前一後的方式，但是神舟十三號飛船的對接情況就不同，是全自主徑向交會對接。這是我們國家載人飛船在太空中實施的第一次徑向交會對接，神舟十三號飛船透過天和核心艙下方對介面與空間站進行交會並對接。之前我們的飛船並沒有試過這樣交會對接，所以神舟十二號飛船在與核心艙分離後，就先完成了空間站的繞飛及徑向交會試驗，為神舟十三號正式實施徑向交會驗證了關鍵技術，以確保首次徑向交會對接任務萬無一失。而飛船在返回的過程中，也需要選擇一個適當的時機，所以神舟十二號飛船返回的過程耗時比較長。

與之前神舟十二號飛船的交會對接方式相比，神舟十三號飛船的交會對接方式更難。首先一個就是持續控制姿態和軌道很難。在一前一後的交會對接中，200米保持點是一個穩定的保持點，就算飛船的發動機不工作，飛船也可以較長時間保持穩定的姿態和軌道。而徑向交會對接沒有穩定的中途停泊點，所以需要持續對飛船的姿態和軌道進行控制，會消耗大量推進劑，故障處置難。

其次是姿態和相對位置的確定很難。載人飛船安裝了敏感器，可以透過觀察星星和預設的標誌點等來確定自己的飛行姿態、與空間站的相對姿態相對位置等。但是在徑向交會過程中，載人飛船需要完成由平飛轉豎飛等大範圍的姿態機動，對敏感器的要求更高，必須保證看得到目標，還不能被複雜的光照干擾。

最後還有一個難題就是航天員手控交會模式非常難。因為在徑向交會對接過程中，基本上失去了地球這個參照基準，測控條件也會變差，增加了航天員操作的難度。

總結：飛船在發射升空之前會計算好飛行軌道，提前選擇好發射視窗，所以前往空間站所需的時間相對較短。而神舟十二號飛船在返回的過程中，還為神舟十三號飛船做了一些技術驗證，在返回的過程中也需要選擇一個時機，所以返回地球時所需時間相對較長。隨著未來我們空間站的建造工作完成以後，很多關鍵技術都會掌握，到時候飛船返回的過程可能會更快了。