大荒305年四月
南際山頂，百花大會。來自南海的神秘少年神農不請自來，大放狂言，以一柄木劍，一合之間，便將琴鼓九仙殺得大敗，舉座皆驚。接著又接連打敗兩名小神位的高手，就連木神與他激鬥四百餘合，也佔不得半點上風。族中長老無一人能認出其師門路數，嘖嘖稱奇。青帝出手止戰，欽點他為當年花魁，他少年成名，春風得意，到處拈花惹草，那一夜宴會，便不知俘獲了多少女子芳心。那一夜，他與丁香仙子並坐山頂溪邊，他摘了一朵碧玉海棠別在丁香發上，卻被她徑直拋入瀑布之中。神農突然從背後將丁香仙子緊緊抱住，吻住了她的耳垂，又說了許多甜言蜜語。丁香仙子至此對神農情根深重，不能自拔。
大荒305年六月
神農重返南際山，將兩朵碧玉海棠送給丁香仙子。兩人相處三日，除了處子之身，丁香仙子幾已將一切都給了神農，早已下定決心，拋下亞聖女之位，與他白頭偕老。空桑仙子來到南際山，在丁香仙子的引見下與神農相見。兩人竟一見鍾情，至此傾心苦戀。數日後，丁香仙子發現兩人戀情，傷心欲絕，由愛生恨，發誓要讓神農和空桑仙子生不如死。神農約見丁香仙子，向她道歉，說明他確是喜歡丁香仙子，但對空桑仙子卻是刻骨銘心般鍾情，今生今世決不更移。丁香仙子若無其事地說自己也是逢場作戲，卻將仇恨深埋心底，神農信以為真。
大荒308年
神農以木劍擊殺三大凶獸之一裂天兕，生擒兇獸赤炎角馬，又在黃河狂濤中與九翼天龍決戰。九翼天龍乃東海龍神縛南仙所變的獸身，兇狂無匹。神農七入黃河，與之大戰三天三夜，數次均可殺她，但念她天資極高，修行不易，勸她改邪歸正。但傅南仙執意不聽。神農無奈，只得將她擒住，囚於天帝山的山洞中，氾濫了七年的山洪方始平息。傅南仙立下重誓，若不擊敗神農，終生不離洞一步。大荒中人不明就裡，紛紛傳說九翼天龍已被神農殺死。五族紛爭更盛，戰火不熄。
大荒310年
神農以劍拜詣崑崙金族白帝，開始二十年以武會盟，恢復神帝制的努力。
大荒326年
神農在樹林中邂逅年少氣盛的靈感仰，鬥到第三百九十二回合，他在靈感仰背上用樹葉寫出“少年英雄”四字，令後者棄劍認輸。
大荒327年
神農在黑水山大破水、木、火三族七神的合圍，威震天下。
大荒330年
神農在崑崙山頂會盟五帝，被尊為神帝。五族重新簽定大荒書，重現和平。
大荒336年
靈感仰鬥劍奪得青帝之位後，先與赤帝比鬥，而後西折天帝山，與神農邀戰，一連比鬥了七年，每次都是戰不過千合，便被神農擊飛‘冷月十一光’，拂袖下山。靈感仰左思右想，認定神農是佔了五德之身的便宜。因此他創出了曠古絕今的‘種神大法’，但苦於無可寄之體，與神農前前後後鬥了三十餘年，始終不敵，心中懊沮自是無以復加。對他如此狂傲之人，神農勝也不是，敗也不是，又生怕他會心病成魔，於是那年在這青帝苑裡，故意與他戰成了平手，說：“不必再比啦。你的武學資質天下無雙，潛力更可謂當世第一。若能心懷寬遠，正氣填膺，他日又有誰是你的對手？”聽了神農這番話，靈感仰這才為其氣度所折服，與他成了至交，從此再不談比武之爭。空桑仙子將無鋒劍送給神農，聊解相思。神農在無鋒劍上用金剛指刻下兩人名字，當作兩情不渝的見證。空桑仙子將剎那芳華曲教與神農。其時二人為五族所迫，蓋因聖女沉於凡俗之情，大大悖於五族聖規，何況所愛之人竟是神帝。兩人逃避眾人追索，來到神農知交青帝的御苑玉屏山。在天湖絕壁上，神農以金剛指刻下兩人合作的歌詞。
大荒357年的一天
空桑仙子與神農約好了在青帝苑相見，丁香仙子知道盧其仙子對空桑仙子素來妒恨，時刻想著取而代之，於是設下連環計，故意讓她得到自己蒐羅的所有證據，又讓她領著長老會與他們撞了個正著。被丁香仙子幾番挑撥，靈感仰怒火中燒，終於準長老會所奏，將空桑仙子流囚湯谷，神農也遭木族連番彈劾，幸得白帝、黃帝、赤帝極力挺護，才得保周全，但也威信大墮。神農身為神帝之尊，不能觸犯五族之約，解救心愛之人，只能目睹空桑仙子東渡湯谷，獨自在南際山頂喝了九十八壇酒，醉得不醒人事。那日他心如死灰，將無鋒劍拋入龍潭之中，單身西遊。
大荒402年
神農離神帝城，孤身遊歷天下，採百草尋長生之藥，此後百餘年，行蹤飄忽，神龍首尾。時有神帝賜藥救人的傳聞不絕於江湖。只要神農尚在人世，天下便太平無事，無為而治。
大荒425年
瘟疫流行於亞洲大陸，兇獸橫行。神農嘗百草制仙藥，解救天下蒼生。
大荒420—430間的某年
無晵國的蛇巫神女硃卷氏野心勃勃，以北海玄蛇為神獸，蛇山為聖都，妄圖重建蛇族王朝，一時間烽火連天，席捲七十六城，天下蛇裔蠻族蠢蠢欲動，接連響應。最後無晵蛇軍終被神農與黑帝聯手擊潰。硃卷氏就是所謂的無晵蛇姥，亦是當年大荒第一妖女。相傳她美貌如花，心如蛇蠍，更有通天法術、不死之身，就連神農亦戰到四百餘合，方才將她制住，流放於北海平丘，她被迫立下毒誓，終身不得離開半步。
大荒430年
西海老祖因犯下大惡，引得神農震怒，追至西海，大戰九百回合後，方才將其斬去右耳，逼迫他立誓此生永不踏入崑崙以東的大荒疆土。
大荒431年前的某年
北海出現一隻極為罕見的巨型毒蛛，生於冰洋底，身長達數里，所吐蛛絲遇水凝結，堅韌劇毒，結成的巨網漂浮海面，就算最為兇暴的狂鯨、巨龍誤陷網中，也掙脫不出。此蛛橫行北海，興風作浪，吞食人畜，危害極大，水族數十名高手圍以追堵截，歷時四年，不但未能將之降伏，反被其吞噬了三十八條性命，由此兇名大著，被排為當時”大荒十大凶獸“之首。直到那年神農路經北海，激戰一日一夜，方才將其封印製服。
大荒某年
神帝神農氏遊玩八閩，路經玉屏山，特上山造訪青帝。而青帝竟閉門睡覺，讓神農在門外乾等了一夜。
大荒某年
神農進入九嶷火山後又安然走出，他是千百年來唯一活著從這九嶷山中出來的人。饒是如此，他亦未曾深入，更沒有找到那蒼梧山鐵木。是以淵博如大荒經，也未能詳細地勾勒其地理。神農亦數次遊歷南荒，踏遍千山萬水，卻與“三天子之都”緣吝一面。《大荒經》中，神農標註了天下所有的地理方位，卻獨獨無法註明此神山所在。大荒483年5月，赤松子在蟠桃會上大顯身手，連青帝也未能在百招之內將他擊敗，神農便封他為大荒雨師。
大荒483年6月
赤松子犯下亂倫罪過，惹動了火族赤帝和水族黑帝，一齊出手，將他擒住，神帝出面求情，才免了他的死罪，把他鎮壓在洞庭湖的五色石下。
大荒530年
雷神因不服神帝之尊，公然挑戰，被神農在太湖之上一劍擊敗，從此兇焰大斂，性情始轉。
大荒539年
黑帝之妹波母仙子因與土族長老公孫長泰私通，產下一子，而被逐出水族，並由此引起了兩族間歷時八個月的大戰。在燭龍指揮下，水族八大天王、燕長歌等四大勁旅傾巢而出，在倚帝山下大敗黃帝親率的九萬大軍。是役，土族元氣大傷，傷亡慘重，僅大將便損失了二十八人。神帝及時介入調停，水族大軍才未直搗黃龍，攻入陽虛城。土族戰敗求和，迫於水族壓力，被迫將公孫長泰和汁玄青母子逐出土族，趕到環境至為惡劣的地壑深溝中居住。那地壑深溝也因此被叫作‘波母之山’，又稱‘皮母地丘’……”那深壑內長滿了惡花毒草、兇禽猛獸，尋常人進去，不消片刻，便連骸骨也剩不下了，就算是仙級高手，也難在壑中熬過七日。神農帝心腸太好，生怕公孫一家難以生存，就將自己煉製的闢毒靈丹，甚至識別草藥的心得一一傳授給他們。得了神農帝相助，公孫長泰一家得以在深壑中住了下來。起初的半年中，神農帝隔三岔五便去看看他們，日子久了，見他們已對周遭的毒草猛獸瞭如指掌，足以應付，這才放心離開，雲遊天下。
大荒553年
北海三百名巫祝引領水族軍士改挖幽水河道時，意外地掘出了傳說中的“幽天玄金碑”。黑帝大喜，以為天意中興水族，急忙下令臣民在傳說中“玄天烏金碑”、“昱天青金碑”沉水的玄水河、昱江遍尋挖掘，想要將這兩塊碑也一齊找到。其他四族聞訊慌亂，不甘示弱，立即在各自疆域內仔細搜尋每一條江河，每一處湖泊，也想挖著上古神碑。但五族費時數月，掘崩了百條河道，引起浩浩水災，仍然未能尋著其他神碑；在神農帝干預之下，這場突如其來的“掘碑大賽”方才不得已終止。
大荒553年
水族黑帝閉關苦修，將族中之事交於聖女烏蘭絲瑪與黑水真神燭龍共掌。當年年末，水族碧藻城因反對燭龍而被滅城，城主季晟山被殺，其妻攜子女、千餘難民奔投木族。青帝因不願與水族生隙，以昔年五族大荒書規定五族不得干涉彼此族內之事為由，拒絕收留。碧藻城婦孺老弱聞訊紛紛自殺。喬羽、段聿鎧等人心中不忍，將剩餘難民收入蜃樓城。燭龍雖礙於青帝之面，未再追究，但青帝以為蜃樓城此舉，乃是對他的大大不敬，一怒之下在長老會議中決議將蜃樓城眾人趕出木族，永不往來。神農為免蜃樓城遭受刀兵之禍，特下令封蜃樓城為“自由之城”，獨立於大荒五族之外。
大荒571年
神帝在皮母地丘內初遇流沙仙子，欲帶她回神帝山化解她體內積毒，被流沙仙子拒絕，便送流沙仙子一塊“辟邪玉”，以辨百毒。後流沙仙子到神帝山尋訪神帝未果，百毒齊發，幸被及時趕到的神帝所救。此後數年，神帝將流沙仙子帶在身邊，逐步化解她體內的劇毒。
大荒573年
流沙仙子為了報仇洩恨，抓了朝陽穀的幾個水妖作為藥罐，種了幾百種蠱毒，卻被神農制止。神農提到，冤家宜解不宜結，尤其朝陽穀水伯心計深沉，堅忍果勇，將來若不成大器，則必成大害。其時天吳剛剛升為水族兩大祭司之一，又新被列為十神之一，但大荒中人卻都說他資質平平，不過是犧牲了其妹龍女討好燭龍，從此才平步青雲。流沙仙子也以此譏笑反駁，說此人是靠著馬屁和裙帶才升為神位，未必勝得過自己的蠱毒，頗不以為然。不想十七年後的東海大戰，流沙仙子目睹天吳盛怒之下畢盡全力，才始信神農所言無虛。
大荒574年
流沙仙子去找公孫影后母子報仇，重傷倒地，幸神帝及時趕到，將她救下。公孫影后暴怒之下，解印混沌兇獸，與神農大戰。戰了不過數百回合，神農便將他和混沌獸一齊制伏，重新封入陰陽冥火壺中。而後又從黃帝那裡借來了‘息壤神土’，將皮毋地丘徹底封住。
大荒575年
神農帶著流沙仙子來到靈山，想向靈山十巫借取‘伏羲牙’，徹底解鎮流沙仙子體內的‘銘心刻骨’毒，靈山十巫自大狂妄，對神帝素來甚為不服，這次有了機會，就吵吵嚷嚷著要與神帝比試，看看誰才是‘大荒第一藥神’。唯有勝得過他們，才有資格借取‘伏羲牙’。靈山十巫輪番上陣，兒天比試下來，輸得一塌糊塗。十巫氣得哇哇亂叫，都說神帝是仗了‘赭鞭’的便宜，勝之不武。於是神農又捨去赭鞭，重新比試，結果還是大勝。靈山十巫氣得吹鬍子瞪眼，惱羞成怒，說既然神農是第一藥神，幹嘛還要眼巴巴地借‘伏羲牙’來救人？竟然就此耍賴不借。神帝無奈之下，只好又主動提出再進行最後一次正式比鬥，這回故意順著靈山十巫的意思，輸了‘藥神’之稱，甚至故意輸了赭鞭，終於使得那靈山十巫心花怒放，甘心借‘伏羲牙’一用。神帝用‘伏羲牙’為流沙仙子解毒，然後便與她分手了。
大荒586年4月
神帝神農氏在南際山頂百草毒發，動彈不得，託鳥兒傳信給流沙仙子，想讓她傳信朝陽穀，停止干戈。流沙仙子卻生氣神帝不來找她，遲遲不肯來南際山。神帝邂逅拓拔野，將神木令、神農丹、百草注、大荒經和五行譜傳於拓拔野，希望能阻止蜃樓城的一場浩劫，而後石化龍牙巖，登仙而去。記：神帝的一生都活得辛勞，而今身歸那世，願他和空桑仙子，青帝等老朋友過上幸福的生活吧。
大荒590年
拓拔野重返大荒，神農弟子，和神帝同為千載難逢的五德之身，身懷神帝的三本奇書，在大荒中多行仁義，他是不是神帝的一種傳承呢？
