張居正在死後被萬曆皇帝清算抄家，歸根到底有兩方面原因，一方面張居正在執政期間，有一些做法讓小皇帝很不滿意。再加上張居正的政治盟友，內相司禮監馮保，在張居正死後不久倒臺。

萬曆皇帝在對馮保進行抄家的過程中，狠狠地撈了一筆，這也讓萬曆皇帝對抄張居正家充滿了期待。張居正是了不起的政治家，在他的帶領下，明朝在統治了150年之後，重新煥發了活力。

張居正能做出這樣的成績，主要靠他的權威性，太后對他無條件支援，司禮監對他無條件支援，小皇帝對他無條件支援。他自己也說自己不是宰相，自己是攝政，他的權威之重整個明朝的文官沒有出其右者。

在這樣的朝堂環境之下，張居正近乎於處於一言堂的狀態

這種獨裁的環境使得張居正的施政理念得以無障礙的落實，整個國家出現了蒸蒸日上的局面。

但是萬曆皇帝不是NPC，他也會思考，為什麼大臣們對張老師唯唯諾諾？為什麼張居正能在朝堂上一呼百應？還不是因為張居正藉助皇權威嚴，利用臣子們對於皇權的敬畏，利用皇帝對他的信任，儼然使他自己和皇權畫上了等號，張居正的意志就等同於皇帝的意志。

這種情況讓萬曆小皇帝非常不滿，他覺得自己的權利被竊取了，他被架空了，朝臣們只知道張居正，只要搞定張居正，皇帝有沒有意見完全無所謂。

這種想法是極為可怕的，但是萬曆皇帝還是比較能夠隱忍的，沒有在張居正活著的時候發作，或者說張居正活著的時候，他沒有這個實力與能力發作。只有在張居正死後，萬曆皇帝失去了約束，這種長久以來的怨念，終於讓他決定清算張居正。

再有一點就是張居正作為萬曆皇帝的老師，對萬曆管的非常嚴格

中國人的理念裡一直就是嚴師出高徒，張居正就是這樣一個嚴師，他對萬曆的學習抓得很緊。

記得有一次萬曆皇帝唸錯一個字，作為大臣的張居正直接不給皇帝面子，二話不說，立即糾正他的發音。這種不講究方式方法的教育，會影響孩子的自尊心，往往會使得孩子有很強的逆反心理。這樣長期以往，就使得萬曆在心中積累了很多的對張居正的不滿。

還有就是張居正的言行不一

張居正出於儒家思想，一直教導皇帝要節儉，要遠離女色。可是到頭來萬曆皇帝發現張居正在經濟上並不乾淨，而且他也是一個非常好色的人，張居正的形象人設在萬曆心中崩塌。萬曆皇帝想一想他對自己的種種教育，就覺得特別可笑，最後的一點憐憫也沒有了。

還有一點就是萬曆皇帝做為天子，卻極其的貪財。張居正的好搭檔，馮保在張居正死後被扳倒，萬曆皇帝對他進行了抄家，結果從他家中抄出了大量的錢財。

這就讓萬曆這個財迷對於抄家產生的濃厚的興趣，他很期待從張居正家中能夠抄出多少錢，所以在這些因素的綜合作用下，他決定對自己的恩師張居正進行抄家清算。